Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh2P43247 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msh2P43247 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msh2P43247 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh2P43247 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh2P43247 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh2P43247 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msh2P43247 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msh2P43247 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh2P43247 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh2P43247 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh2P43247 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh2P43247 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Msh2P43247 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh2P43247 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh2P43247 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh2P43247 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh2P43247 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msh2P43247 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms