Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtgfrP43117 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtgfrP43117 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms