Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TtlP38585 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TtlP38585 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TtlP38585 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TtlP38585 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TtlP38585 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TtlP38585 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TtlP38585 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TtlP38585 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TtlP38585 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TtlP38585 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TtlP38585 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TtlP38585 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TtlP38585 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TtlP38585 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TtlP38585 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TtlP38585 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TtlP38585 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TtlP38585 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TtlP38585 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TtlP38585 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TtlP38585 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TtlP38585 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TtlP38585 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TtlP38585 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TtlP38585 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TtlP38585 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TtlP38585 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TtlP38585 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TtlP38585 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TtlP38585 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TtlP38585 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TtlP38585 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TtlP38585 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TtlP38585 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TtlP38585 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TtlP38585 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TtlP38585 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TtlP38585 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TtlP38585 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TtlP38585 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TtlP38585 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TtlP38585 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TtlP38585 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TtlP38585 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TtlP38585 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TtlP38585 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TtlP38585 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TtlP38585 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TtlP38585 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TtlP38585 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TtlP38585 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TtlP38585 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TtlP38585 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TtlP38585 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TtlP38585 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TtlP38585 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TtlP38585 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TtlP38585 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TtlP38585 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TtlP38585 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TtlP38585 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TtlP38585 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TtlP38585 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TtlP38585 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TtlP38585 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TtlP38585 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TtlP38585 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TtlP38585 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TtlP38585 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TtlP38585 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TtlP38585 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TtlP38585 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TtlP38585 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TtlP38585 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TtlP38585 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TtlP38585 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TtlP38585 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TtlP38585 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TtlP38585 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TtlP38585 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TtlP38585 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TtlP38585 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TtlP38585 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TtlP38585 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TtlP38585 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TtlP38585 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TtlP38585 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TtlP38585 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TtlP38585 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TtlP38585 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TtlP38585 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TtlP38585 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TtlP38585 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TtlP38585 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TtlP38585 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TtlP38585 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TtlP38585 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TtlP38585 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TtlP38585 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms