Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab23P35288 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab23P35288 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab23P35288 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab23P35288 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab23P35288 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab23P35288 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab23P35288 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab23P35288 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab23P35288 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab23P35288 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab23P35288 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms