Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxc5P32043 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxc5P32043 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms