Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa4P31532 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Saa4P31532 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Saa4P31532 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Saa4P31532 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa4P31532 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa4P31532 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa4P31532 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Saa4P31532 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Saa4P31532 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Saa4P31532 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Saa4P31532 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Saa4P31532 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Saa4P31532 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Saa4P31532 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms