Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxc10P31257 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxc10P31257 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxc10P31257 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms