Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RxraP28700 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RxraP28700 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RxraP28700 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RxraP28700 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxraP28700 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxraP28700 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxraP28700 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxraP28700 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxraP28700 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxraP28700 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxraP28700 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxraP28700 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxraP28700 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RxraP28700 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RxraP28700 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RxraP28700 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RxraP28700 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RxraP28700 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RxraP28700 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RxraP28700 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxraP28700 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxraP28700 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxraP28700 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxraP28700 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxraP28700 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RxraP28700 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxraP28700 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxraP28700 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxraP28700 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RxraP28700 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxraP28700 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxraP28700 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxraP28700 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxraP28700 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RxraP28700 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxraP28700 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxraP28700 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RxraP28700 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxraP28700 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxraP28700 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RxraP28700 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RxraP28700 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RxraP28700 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RxraP28700 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RxraP28700 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RxraP28700 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxraP28700 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxraP28700 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxraP28700 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxraP28700 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxraP28700 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxraP28700 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxraP28700 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxraP28700 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RxraP28700 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxraP28700 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxraP28700 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxraP28700 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RxraP28700 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxraP28700 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxraP28700 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxraP28700 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RxraP28700 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxraP28700 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxraP28700 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxraP28700 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxraP28700 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RxraP28700 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxraP28700 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxraP28700 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxraP28700 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxraP28700 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxraP28700 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxraP28700 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxraP28700 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxraP28700 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxraP28700 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RxraP28700 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RxraP28700 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxraP28700 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxraP28700 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxraP28700 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RxraP28700 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RxraP28700 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxraP28700 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxraP28700 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RxraP28700 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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