Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Marcksl1P28667 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Marcksl1P28667 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Marcksl1P28667 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Marcksl1P28667 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms