Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde6aP27664 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pde6aP27664 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pde6aP27664 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde6aP27664 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms