Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afxP27661 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2afxP27661 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2afxP27661 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2afxP27661 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afxP27661 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afxP27661 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afxP27661 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afxP27661 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2afxP27661 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afxP27661 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afxP27661 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afxP27661 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afxP27661 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2afxP27661 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2afxP27661 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afxP27661 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afxP27661 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms