Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tgfb2P27090 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tgfb2P27090 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tgfb2P27090 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tgfb2P27090 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms