Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf8P23611 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf8P23611 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf8P23611 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf8P23611 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf8P23611 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf8P23611 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf8P23611 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf8P23611 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.4 ms