Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ggta1P23336 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggta1P23336 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggta1P23336 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms