Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfaP20033 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfaP20033 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfaP20033 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfaP20033 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfaP20033 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfaP20033 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfaP20033 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfaP20033 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfaP20033 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfaP20033 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PdgfaP20033 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfaP20033 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfaP20033 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfaP20033 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfaP20033 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfaP20033 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfaP20033 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfaP20033 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfaP20033 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfaP20033 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfaP20033 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PdgfaP20033 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms