Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnnc1P19123 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnnc1P19123 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnnc1P19123 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnnc1P19123 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms