Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcna1P16388 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcna1P16388 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcna1P16388 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna1P16388 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms