Protein–RNA interactions for Protein: P16301

Lcat, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcatP16301 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcatP16301 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcatP16301 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcatP16301 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcatP16301 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcatP16301 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LcatP16301 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LcatP16301 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LcatP16301 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LcatP16301 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LcatP16301 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LcatP16301 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LcatP16301 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LcatP16301 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcatP16301 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcatP16301 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcatP16301 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcatP16301 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcatP16301 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcatP16301 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LcatP16301 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcatP16301 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcatP16301 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcatP16301 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcatP16301 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcatP16301 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcatP16301 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcatP16301 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcatP16301 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LcatP16301 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LcatP16301 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LcatP16301 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcatP16301 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcatP16301 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcatP16301 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcatP16301 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LcatP16301 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LcatP16301 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LcatP16301 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LcatP16301 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LcatP16301 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LcatP16301 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcatP16301 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcatP16301 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcatP16301 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcatP16301 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LcatP16301 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcatP16301 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcatP16301 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcatP16301 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LcatP16301 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LcatP16301 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcatP16301 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcatP16301 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcatP16301 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcatP16301 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcatP16301 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcatP16301 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcatP16301 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcatP16301 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LcatP16301 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LcatP16301 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LcatP16301 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LcatP16301 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LcatP16301 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LcatP16301 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LcatP16301 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LcatP16301 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LcatP16301 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LcatP16301 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LcatP16301 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LcatP16301 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LcatP16301 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LcatP16301 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LcatP16301 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LcatP16301 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LcatP16301 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LcatP16301 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LcatP16301 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LcatP16301 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LcatP16301 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcatP16301 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcatP16301 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcatP16301 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcatP16301 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcatP16301 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcatP16301 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcatP16301 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcatP16301 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcatP16301 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LcatP16301 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LcatP16301 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LcatP16301 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LcatP16301 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LcatP16301 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LcatP16301 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LcatP16301 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LcatP16301 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LcatP16301 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LcatP16301 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms