Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SptbP15508 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SptbP15508 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SptbP15508 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SptbP15508 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SptbP15508 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SptbP15508 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SptbP15508 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SptbP15508 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SptbP15508 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SptbP15508 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SptbP15508 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SptbP15508 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SptbP15508 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SptbP15508 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SptbP15508 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SptbP15508 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SptbP15508 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SptbP15508 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SptbP15508 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SptbP15508 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SptbP15508 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SptbP15508 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SptbP15508 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SptbP15508 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SptbP15508 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SptbP15508 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SptbP15508 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SptbP15508 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SptbP15508 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SptbP15508 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SptbP15508 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SptbP15508 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SptbP15508 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SptbP15508 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SptbP15508 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SptbP15508 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SptbP15508 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SptbP15508 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SptbP15508 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SptbP15508 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SptbP15508 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SptbP15508 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SptbP15508 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SptbP15508 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SptbP15508 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SptbP15508 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SptbP15508 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SptbP15508 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SptbP15508 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SptbP15508 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SptbP15508 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SptbP15508 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SptbP15508 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SptbP15508 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SptbP15508 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SptbP15508 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SptbP15508 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SptbP15508 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SptbP15508 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SptbP15508 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SptbP15508 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SptbP15508 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SptbP15508 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SptbP15508 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SptbP15508 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SptbP15508 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SptbP15508 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SptbP15508 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SptbP15508 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SptbP15508 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SptbP15508 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SptbP15508 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SptbP15508 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SptbP15508 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SptbP15508 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SptbP15508 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SptbP15508 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SptbP15508 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SptbP15508 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SptbP15508 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SptbP15508 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SptbP15508 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SptbP15508 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SptbP15508 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SptbP15508 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SptbP15508 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SptbP15508 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SptbP15508 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms