Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myf6P15375 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myf6P15375 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myf6P15375 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myf6P15375 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myf6P15375 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myf6P15375 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myf6P15375 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf6P15375 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Myf6P15375 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf6P15375 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf6P15375 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Myf6P15375 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms