Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr4a1P12813 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nr4a1P12813 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms