Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd1d1P11609 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd1d1P11609 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms