Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RaraP11416 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RaraP11416 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RaraP11416 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RaraP11416 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RaraP11416 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RaraP11416 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RaraP11416 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RaraP11416 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RaraP11416 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RaraP11416 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RaraP11416 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RaraP11416 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RaraP11416 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaraP11416 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RaraP11416 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaraP11416 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaraP11416 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaraP11416 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaraP11416 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaraP11416 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaraP11416 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RaraP11416 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaraP11416 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RaraP11416 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaraP11416 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaraP11416 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaraP11416 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaraP11416 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaraP11416 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RaraP11416 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RaraP11416 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RaraP11416 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RaraP11416 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RaraP11416 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RaraP11416 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RaraP11416 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RaraP11416 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RaraP11416 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RaraP11416 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RaraP11416 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RaraP11416 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RaraP11416 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RaraP11416 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RaraP11416 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RaraP11416 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RaraP11416 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RaraP11416 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RaraP11416 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RaraP11416 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RaraP11416 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RaraP11416 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RaraP11416 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RaraP11416 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RaraP11416 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RaraP11416 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RaraP11416 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RaraP11416 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RaraP11416 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RaraP11416 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RaraP11416 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RaraP11416 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RaraP11416 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RaraP11416 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RaraP11416 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RaraP11416 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RaraP11416 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RaraP11416 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RaraP11416 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RaraP11416 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RaraP11416 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RaraP11416 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RaraP11416 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RaraP11416 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RaraP11416 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RaraP11416 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RaraP11416 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RaraP11416 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RaraP11416 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RaraP11416 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RaraP11416 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RaraP11416 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RaraP11416 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RaraP11416 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RaraP11416 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RaraP11416 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RaraP11416 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RaraP11416 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RaraP11416 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RaraP11416 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RaraP11416 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RaraP11416 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RaraP11416 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RaraP11416 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RaraP11416 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RaraP11416 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RaraP11416 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RaraP11416 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RaraP11416 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RaraP11416 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms