Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolP11369 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PolP11369 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolP11369 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolP11369 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolP11369 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolP11369 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolP11369 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolP11369 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolP11369 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolP11369 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolP11369 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PolP11369 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolP11369 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolP11369 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolP11369 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolP11369 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolP11369 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolP11369 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolP11369 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolP11369 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolP11369 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolP11369 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolP11369 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolP11369 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolP11369 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PolP11369 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolP11369 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolP11369 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolP11369 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolP11369 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolP11369 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PolP11369 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PolP11369 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolP11369 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolP11369 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PolP11369 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolP11369 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolP11369 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolP11369 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolP11369 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolP11369 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolP11369 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolP11369 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolP11369 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolP11369 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolP11369 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolP11369 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolP11369 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolP11369 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolP11369 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolP11369 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolP11369 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolP11369 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolP11369 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolP11369 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolP11369 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolP11369 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolP11369 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PolP11369 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolP11369 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PolP11369 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PolP11369 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PolP11369 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolP11369 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolP11369 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolP11369 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolP11369 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PolP11369 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolP11369 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolP11369 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolP11369 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolP11369 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolP11369 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolP11369 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolP11369 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolP11369 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolP11369 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PolP11369 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolP11369 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolP11369 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolP11369 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolP11369 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PolP11369 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolP11369 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolP11369 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolP11369 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolP11369 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms