Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calm3P0DP28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calm3P0DP28 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Calm3P0DP28 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms