Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6c1P0CW02 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ly6c1P0CW02 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ly6c1P0CW02 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms