Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sbk3P0C5K0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbk3P0C5K0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sbk3P0C5K0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms