Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp6P0C0A3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp6P0C0A3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp6P0C0A3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms