Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtrP07309 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtrP07309 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TtrP07309 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TtrP07309 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TtrP07309 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TtrP07309 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtrP07309 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtrP07309 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TtrP07309 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TtrP07309 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtrP07309 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TtrP07309 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TtrP07309 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtrP07309 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtrP07309 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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TtrP07309 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtrP07309 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtrP07309 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtrP07309 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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