Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gap43P06837 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gap43P06837 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gap43P06837 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gap43P06837 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gap43P06837 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gap43P06837 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gap43P06837 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gap43P06837 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gap43P06837 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms