Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myl1P05977 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myl1P05977 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myl1P05977 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myl1P05977 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Myl1P05977 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myl1P05977 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myl1P05977 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Myl1P05977 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myl1P05977 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Myl1P05977 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myl1P05977 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Myl1P05977 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms