Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prp2P05143 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prp2P05143 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prp2P05143 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prp2P05143 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prp2P05143 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prp2P05143 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prp2P05143 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prp2P05143 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prp2P05143 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prp2P05143 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prp2P05143 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prp2P05143 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prp2P05143 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prp2P05143 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prp2P05143 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prp2P05143 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prp2P05143 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prp2P05143 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prp2P05143 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prp2P05143 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prp2P05143 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prp2P05143 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prp2P05143 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prp2P05143 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prp2P05143 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prp2P05143 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prp2P05143 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prp2P05143 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prp2P05143 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prp2P05143 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prp2P05143 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prp2P05143 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prp2P05143 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prp2P05143 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prp2P05143 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prp2P05143 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prp2P05143 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prp2P05143 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prp2P05143 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prp2P05143 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prp2P05143 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prp2P05143 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Prp2P05143 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prp2P05143 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prp2P05143 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prp2P05143 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prp2P05143 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prp2P05143 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prp2P05143 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prp2P05143 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prp2P05143 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prp2P05143 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms