Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cd3dP04235 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cd3dP04235 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cd3dP04235 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cd3dP04235 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd3dP04235 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd3dP04235 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms