Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tp53P02340 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tp53P02340 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tp53P02340 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53P02340 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tp53P02340 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tp53P02340 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tp53P02340 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tp53P02340 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53P02340 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53P02340 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53P02340 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tp53P02340 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tp53P02340 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms