Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01747 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01747 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01747 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01747 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01747 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01747 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01747 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01747 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01747 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01747 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01747 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01747 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01747 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01747 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01747 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01747 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01747 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01747 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01747 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01747 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01747 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01747 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01747 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01747 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01747 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01747 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01747 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01747 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01747 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01747 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01747 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01747 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01747 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01747 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01747 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01747 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01747 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01747 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01747 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01747 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01747 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01747 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01747 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01747 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01747 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01747 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01747 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01747 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01747 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01747 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01747 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01747 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01747 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01747 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01747 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01747 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01747 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01747 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01747 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01747 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01747 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01747 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01747 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01747 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01747 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01747 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01747 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01747 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01747 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01747 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01747 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01747 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01747 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01747 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01747 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01747 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01747 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01747 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01747 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01747 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01747 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01747 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01747 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01747 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01747 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01747 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01747 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms