Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01667 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01667 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01667 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01667 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01667 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01667 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01667 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01667 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
P01667 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01667 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
P01667 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01667 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01667 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01667 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01667 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01667 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01667 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01667 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01667 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01667 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01667 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01667 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01667 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01667 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01667 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01667 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01667 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01667 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01667 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01667 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01667 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01667 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01667 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01667 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01667 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01667 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01667 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01667 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01667 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01667 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01667 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01667 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01667 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01667 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01667 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01667 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01667 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01667 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01667 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01667 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
P01667 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01667 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01667 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
P01667 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01667 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01667 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01667 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01667 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01667 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01667 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01667 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01667 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01667 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
P01667 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
P01667 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01667 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01667 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01667 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01667 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01667 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01667 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01667 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01667 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01667 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01667 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01667 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P01667 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01667 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01667 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01667 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01667 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01667 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01667 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01667 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01667 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01667 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01667 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01667 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01667 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01667 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01667 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01667 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01667 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01667 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01667 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01667 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01667 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P01667 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
P01667 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms