Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01650 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01650 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01650 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01650 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01650 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01650 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01650 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01650 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01650 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01650 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01650 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01650 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01650 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01650 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01650 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P01650 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01650 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01650 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01650 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01650 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01650 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01650 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01650 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01650 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
P01650 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01650 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01650 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01650 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01650 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01650 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01650 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01650 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01650 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01650 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
P01650 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01650 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01650 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
P01650 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01650 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01650 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01650 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01650 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01650 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01650 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01650 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P01650 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01650 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01650 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01650 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
P01650 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01650 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01650 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01650 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01650 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01650 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01650 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01650 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01650 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01650 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01650 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01650 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01650 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01650 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01650 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01650 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P01650 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01650 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01650 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01650 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01650 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01650 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01650 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01650 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01650 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01650 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01650 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01650 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01650 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01650 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01650 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01650 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01650 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01650 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01650 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01650 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01650 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01650 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01650 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01650 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01650 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01650 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01650 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01650 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01650 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01650 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01650 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01650 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01650 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01650 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms