Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01648 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01648 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01648 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01648 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01648 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01648 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01648 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01648 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01648 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01648 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01648 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01648 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01648 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
P01648 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01648 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01648 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01648 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01648 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01648 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01648 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
P01648 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01648 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01648 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01648 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01648 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01648 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01648 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01648 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
P01648 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01648 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01648 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P01648 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01648 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01648 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01648 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01648 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01648 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01648 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01648 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01648 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01648 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01648 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01648 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01648 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01648 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01648 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01648 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01648 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01648 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01648 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01648 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01648 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01648 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
P01648 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01648 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01648 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01648 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01648 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01648 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01648 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01648 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01648 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P01648 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01648 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01648 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01648 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01648 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01648 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
P01648 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01648 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01648 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01648 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01648 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01648 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01648 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01648 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01648 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01648 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01648 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01648 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P01648 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01648 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01648 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01648 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01648 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01648 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01648 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01648 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01648 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01648 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01648 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01648 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01648 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01648 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01648 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
P01648 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01648 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01648 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P01648 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms