Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01641 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
P01641 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01641 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01641 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01641 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01641 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01641 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01641 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P01641 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01641 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01641 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01641 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01641 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01641 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01641 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01641 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01641 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01641 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01641 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01641 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01641 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P01641 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01641 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01641 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01641 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01641 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01641 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01641 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P01641 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01641 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01641 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P01641 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01641 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01641 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P01641 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01641 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01641 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01641 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01641 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01641 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01641 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01641 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01641 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
P01641 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01641 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
P01641 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01641 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01641 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01641 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P01641 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01641 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01641 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01641 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01641 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01641 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01641 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01641 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01641 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01641 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01641 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P01641 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01641 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01641 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01641 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01641 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01641 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01641 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
P01641 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01641 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01641 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01641 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01641 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01641 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01641 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01641 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01641 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01641 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01641 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01641 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01641 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01641 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01641 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01641 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01641 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01641 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01641 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01641 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01641 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01641 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01641 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01641 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01641 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01641 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01641 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01641 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01641 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01641 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01641 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01641 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms