Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Robo1O89026 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Robo1O89026 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Robo1O89026 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Robo1O89026 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Robo1O89026 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Robo1O89026 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Robo1O89026 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Robo1O89026 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Robo1O89026 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Robo1O89026 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Robo1O89026 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Robo1O89026 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Robo1O89026 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms