Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcn2O88703 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcn2O88703 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms