Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vti1bO88384 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vti1bO88384 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vti1bO88384 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms