Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx12O70493 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx12O70493 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx12O70493 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx12O70493 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx12O70493 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx12O70493 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx12O70493 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx12O70493 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx12O70493 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx12O70493 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx12O70493 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx12O70493 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx12O70493 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx12O70493 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms