Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmx1O70218 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmx1O70218 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hmx1O70218 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hmx1O70218 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms