Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HcrtO55241 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HcrtO55241 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HcrtO55241 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HcrtO55241 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HcrtO55241 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HcrtO55241 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HcrtO55241 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HcrtO55241 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HcrtO55241 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HcrtO55241 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HcrtO55241 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HcrtO55241 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HcrtO55241 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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