Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ldb2O55203 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ldb2O55203 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ldb2O55203 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms