Protein–RNA interactions for Protein: O55137

Acot1, Acyl-coenzyme A thioesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot1O55137 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acot1O55137 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acot1O55137 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acot1O55137 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Acot1O55137 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acot1O55137 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acot1O55137 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acot1O55137 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Acot1O55137 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms