Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyp26a1O55127 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyp26a1O55127 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyp26a1O55127 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyp26a1O55127 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms