Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nipsnap1O55125 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nipsnap1O55125 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap1O55125 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms