Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom1O54990 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom1O54990 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prom1O54990 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prom1O54990 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom1O54990 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prom1O54990 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prom1O54990 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prom1O54990 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prom1O54990 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prom1O54990 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms